王国纪元的副本系统是游戏核心玩法之一，其关卡数量随着版本更新持续扩充，目前已知的副本章节数量超过20章，每章包含10-15个独立关卡，总关卡数约300个以上。副本采用线性推进机制，玩家需逐章解锁，难度呈阶梯式增长，早期章节以教学引导为主，后期则考验综合策略能力。精英副本与普通副本共享同一章节结构，但挑战难度和奖励品质显著提升，这实质上将可重复挑战的关卡数量翻倍。副本进度与玩家城堡等级、英雄培养度直接相关，高等级副本需要匹配的战斗力数值作为进入门槛。
副本关卡的战斗机制分为三种基础类型：普通推图关卡要求全歼敌人；BOSS战关卡需在限定时间内击败首领；特殊机制关卡则包含护送、防守等多样化目标。每通关一个章节可获得对应的英雄碎片、装备材料及经验奖励，三星通关后解锁扫荡功能。行动力系统限制每日挑战次数，但失败不消耗体力，允许玩家反复尝试调整战术。从资源获取效率分析，第8章至第12章是多数玩家重点反复刷取的中期资源节点，这些章节的产出平衡了难度与收益。
英雄搭配对通关效率具有决定性影响。标准阵容需包含坦克、治疗和AOE输出三类角色，前期推荐使用誓言骑士、光明之子作为防御核心，搭配愤怒射手、金嗓子等群体伤害英雄。后期高难度副本则需要血色闪电、狩魔猎人等高爆发英雄应对特殊机制。装备系统方面，建议优先制作增加建造速度和研发速度的统御装备，如哈普刚肯套装和格里芬套装，这些装备能同步提升副本外的发育效率。英雄军阶提升所需的战利品需在特定章节反复刷取，这是长期卡点之一。
副本进度与整体战力提升形成循环体系。通关奖励的英雄碎片用于解锁新角色，而新角色又能助力攻克更高难度副本。科技研发中的军事类项目直接影响副本表现，尤其是兵种克制和军团加成科技需优先点满。对于卡关情况，建议从三方面入手：调整英雄站位规避关键伤害，优化技能释放时机打断敌方大招，或是暂时回归低阶副本积累资源。部分章节存在隐藏成就，达成后能获取额外钻石奖励，这类设计增加了探索深度。
通过联盟求助功能可快速获取稀缺装备材料，而联盟礼物中开出的体力药剂能增加副本挑战次数。每周的联盟总动员活动要求成员共同完成副本挑战任务，这是获取稀有勋章的重要渠道。后期副本如黑暗森林和巨龙之巢需要多人协作才能高效通关，建议组建固定队伍研究机制配合。游戏版本更新通常会新增2-3个章节，并伴随新的副本机制引入，保持对公告的关注有助于提前准备应对策略。
